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DNA Extraction

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實驗流程


WizardTM Genomic DNA Purification
 

  • 產量多且品質優越，
  • 適用於廣泛樣本種類。
  • 一小時即可完成抽取。
  • 可依比例調整試劑，提高產量。
  • 品質優越，適於各種用途。
     

樣本種類及產量表

產品流程


Wizard® SV Genomic DNA Purification System
 
產量多且品質優越

  • 適用於廣泛樣本種類。
  • 簡單快速的操作步驟， 20 分鐘即可完成抽取。
  • 可選用離心法或真空抽氣法。

樣品純化評估

操作流程


Wizard® SV Gel and PCR Clean-Up System

  • 15 分鐘即可完成抽取。
  • 回收率高，有效降低樣本流失。
  • 管柱可結合高達 40µg 的 DNA 樣本。
  • 可純化高達 10kb 的片段。
  • 無需處理即可應用 ( 如 sequencing, cloning, labeling, RE digestion or in vitro transcription/translation) 。

 

廠牌比較

 

片段大小Wizard® SV Gel and PCR Clean-Up SystemQ 牌 Gel Extraction Kit
55bp26%32%
70bp39%41%
85bp55%61%
100bp84%65%
500bp89%91%
1,000bp92%75%

強效的純化效能，可避免樣品流失！

Wizard®純化 系列
 

  • 純化技術多樣，包括 membrane 、 resin 及磁珠系統。
  • 符合您各種樣本的抽取量，亦有大批次純化模式。
  • 品質穩定，價位合宜。
  • 包裝多樣，產量理想。
     
PLASMID PURIFICATIONPDF (size)
TB225Wizard ® Plus SV Minipreps DNA Purification System157kb
TB117Wizard ® Plus Minipreps DNA Purification System231kb
TB173Wizard ® Plus Midipreps DNA Purification System210kb
TB139Wizard ® Plus Maxipreps DNA Purification System213kb
TB140Wizard ® Plus Megapreps DNA Purification System207kb
PLASMID PURIFICATION: HIGH-THROUGHPUTPDF (size)
TB314Wizard MagneSil Tfx™ System271kb
TB272Wizard ® SV 96 Plasmid DNA Purification System705kb
TB292Wizard ® SV 9600 Plasmid DNA Purification System370kb
TB286Wizard ® MagneSil ® Plasmid DNA Purification System321kb

SV Total RNA Isolation System
 

  • 產量優異，操作簡易。
  • 縮短純化時間至一小時。
  • 無需使用危險溶劑。
  • 適用於純化多種樣本。
  • 適用於一般分生用途。

 

     各種樣本抽取效能評比

樣本種類樣本樣本起始量產量產率A 260/A230A 260/A280
( mg)( μg/prep )( μg/mg tissue)
小鼠組織Liver301334.42.41.9
Kidney20462.32.11.9
Heart60160.31.82.1
Spleen15795.32.31.9
Brain60390.72.12.1
Lung60360.622.1
Muscle30220.71.82.1
細胞株RAW264.7 Cell Line5 x 106 cells51-22
植物Tomato Leaf304.60.151.352
酵母菌S . cerevisiae4x 107 cells19-1.62.1
細菌E.coli1x 109 cells36.1-1.642

Wizard® HMW DNA Extraction Kit

  • 純化高分子量DNA以進行Long-Read Sequencing
  • 提取高純度HMW DNA的Optimized protocol
  • 在Oxford Nanopore Technologies® instruments可得Reliable performance
  • 不含有害化學物質的Rapid protocol
  • 90分鐘的手動操作，即可獲得最大500 kb的DNA

 

DNA定序技術快速發展，使得短時間內可以提供大量序列數據。

PacBio®Sequel II系統和Oxford Nanopore Technologies ® MinIon®的平台在讀取長度和準確性皆有更進一步的突破。除了具有很高的單鹼基準確度，其讀取長度超過2Mb。

使用這些平台的前提會取決於分離(純化)和保存高分子量(HMW)DNA的大片段的能力。

以往常用方法耗費資源也相對昂貴，在純化出的DNA在定序中表現不佳。因此Promega在這項研究中，提供一種新方法提高DNA提取能力，從而在Long Read Sequencing (LRS)中產生高性能且不會在整個Workflow或試劑成本上造成不必要的負擔。與競爭對手相比，Wizard®HMW DNA提取試劑盒可以分離出更高比例的具有較高N50值的長片段，表示樣品中較大片段的比例更高。

該試劑盒可從多種樣品中純化，例如全血、細菌培養物、細胞和植物葉片組織中純化長片段核酸。

 

HMW DNA in Long-Read Sequencing

使用Wizard®HMW DNA從人血和cultured K562 mammalian cells樣品提取高分子量DNA。 這些樣品基於 ligation-based library preparation method進行定測序，並使用Oxford NanoporeTechnologies®MinION®儀器進行上機。

上表顯示Wizard®HMW可提取大的DNA片段，並具有出色的定序性能。 N50指標可量化讀取長度，超過該長度可得出一半的數據，且讀取數量大於100kb的Data有益於解決Large structural variants或Large gaps in genome assemblies

Yield and Purity

上表使用Wizard®HMW DNA提取試劑盒從不同樣品類型中提取DNA。發現提取的DNA具高純度。並基於Dye-based QuantiFluor® dsDNA System測量產量。 獲得的產率和純度足皆以滿足常見的Long-Read Sequencing的應用與需求。

Gel Analysis

藉由Pulsed-field gel electrophoresis (PFGE)分析，以估算高分子量片段的大小分佈。所有樣品類型均產生HMW DNA(Commonly defined as being 50kb or larger)。值得注意的是，某些樣本的片段最大為500kb。

Quantitative Fragment Analysis

使用Agilent Femto Pulse System對HMW DNA樣品中片段的大小分佈進行定量。 該系統產生的數據可以Viewed as a traditional electropherogram，也可以使用GQN(Genomic quality number)進行評估。GQN可以依照給定的Fragment size進行評估，並顯示指定大小或更大片段的百分比數據。使用這種方法，分析了使用Wizard®HMW DNA Kit提取的樣品，並將結果報告在上表中。數據顯示，即使是具有挑戰性的樣品類型，大多數純化的DNA都超過50kb，在許多情況下，大多數提取的DNA都超過100kb。